Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc66Q6NS45 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc66Q6NS45 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms