Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap5lQ6GQX2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap5lQ6GQX2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap5lQ6GQX2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap5lQ6GQX2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap5lQ6GQX2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap5lQ6GQX2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap5lQ6GQX2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap5lQ6GQX2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nckap5lQ6GQX2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nckap5lQ6GQX2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms