Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pram1Q6BCL1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pram1Q6BCL1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms