Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno1Q689Z5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms