Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CilpQ66K08 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms