Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ino80dQ66JY2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80dQ66JY2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms