Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrc8eQ66JT1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms