Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a5Q63ZW6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms