Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms