Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Polr2kQ63871 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Polr2kQ63871 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms