Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf260Q62513 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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Znf260Q62513 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf260Q62513 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf260Q62513 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf260Q62513 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Znf260Q62513 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf260Q62513 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf260Q62513 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Znf260Q62513 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf260Q62513 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf260Q62513 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf260Q62513 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf260Q62513 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf260Q62513 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf260Q62513 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf260Q62513 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Znf260Q62513 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf260Q62513 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf260Q62513 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf260Q62513 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf260Q62513 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf260Q62513 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf260Q62513 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf260Q62513 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf260Q62513 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf260Q62513 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf260Q62513 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf260Q62513 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf260Q62513 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf260Q62513 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf260Q62513 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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