Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3gl2Q62420 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3gl2Q62420 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms