Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SpegQ62407 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpegQ62407 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SpegQ62407 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms