Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zpr1Q62384 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms