Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18Q62280 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms