Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sptbn1Q62261 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sptbn1Q62261 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sptbn1Q62261 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sptbn1Q62261 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptbn1Q62261 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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