Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ttf1Q62187 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ttf1Q62187 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ttf1Q62187 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ttf1Q62187 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ttf1Q62187 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttf1Q62187 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttf1Q62187 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttf1Q62187 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttf1Q62187 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttf1Q62187 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttf1Q62187 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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