Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms