Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Scarb1Q61009 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scarb1Q61009 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scarb1Q61009 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scarb1Q61009 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scarb1Q61009 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scarb1Q61009 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scarb1Q61009 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Scarb1Q61009 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Scarb1Q61009 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Scarb1Q61009 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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