Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik1Q60934 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms