Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Irgm1Q60766 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Irgm1Q60766 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Irgm1Q60766 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Irgm1Q60766 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Irgm1Q60766 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irgm1Q60766 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms