Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a1Q60737 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms