Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClpbQ60649 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClpbQ60649 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms