Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms