Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms