Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

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Length 663 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rnf145Q5SWK7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rnf145Q5SWK7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf145Q5SWK7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf145Q5SWK7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf145Q5SWK7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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