Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms