Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms