Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prune2Q52KR3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms