Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otol1Q4ZJM7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otol1Q4ZJM7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otol1Q4ZJM7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otol1Q4ZJM7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otol1Q4ZJM7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otol1Q4ZJM7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otol1Q4ZJM7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms