Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a5Q4LDG0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a5Q4LDG0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms