Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shank3Q4ACU6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms