Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Snx25Q3ZT31 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Snx25Q3ZT31 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Snx25Q3ZT31 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Snx25Q3ZT31 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Snx25Q3ZT31 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx25Q3ZT31 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx25Q3ZT31 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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