Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmub2Q3V209 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms