Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn34b4Q3V0X2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn34b4Q3V0X2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn34b4Q3V0X2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn34b4Q3V0X2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn34b4Q3V0X2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn34b4Q3V0X2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn34b4Q3V0X2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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