Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms