Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms