Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox3Q3UT54 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox3Q3UT54 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms