Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms