Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm20Q3UQS8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms