Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms