Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef40Q3UPH7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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