Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms