Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms