Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf224Q3UIW8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf224Q3UIW8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf224Q3UIW8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf224Q3UIW8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf224Q3UIW8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf224Q3UIW8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms