Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms