Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc34Q3UI66 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc34Q3UI66 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms