Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Puf60Q3UEB3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Puf60Q3UEB3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms