Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
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Gtpbp6Q3U6U5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Gtpbp6Q3U6U5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Gtpbp6Q3U6U5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Gtpbp6Q3U6U5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Gtpbp6Q3U6U5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Gtpbp6Q3U6U5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Gtpbp6Q3U6U5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Gtpbp6Q3U6U5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Gtpbp6Q3U6U5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms