Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms